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Publications (Please take a look at my Lattes Curriculum-Vitae, ResearcherID, ORCID or MyCitations (Google Scholar) for up-to-date information):
2017
  • Baranauskas, J. A., Netto, O. P., Nozawa, S.R., Macedo, A. A. A tree-based algorithm for attribute selection. Applied Intelligence, 2017 (in print).
    (DOI 10.1007/s10489-017-1008-y)

2016

  • Macedo, A. A., Pollettini, J. T., Baranauskas, J. A., Chaves, J. C. A.  A Health Surveillance Software Framework to Deliver Information on Preventive Healthcare Strategies, Journal of Biomedical Informatics, V.62, p. 159-170, 2016.
    (DOI 10.1016/j.jbi.2016.06.002)
  • Macedo, A. A., Ruiz, E. E. S., Baranauskas, J. A. A Survey of the Job Profiles of Biomedical Informatics Graduates. Methods of Information in Medicine, V 55, Issue 5, p. 473-477, 2016.
    (DOI 10.3414/ME15-01-0144)
  • Perez, P.S.; Nozawa, S.R.; Macedo, A.A.; Baranauskas, J.A. Windowing improvements towards more comprehensible models. Knowledge-Based Systems, v. 92, p. 9-22, 2016.
    (DOI 10.1016/j.knosys.2015.10.011)

2015

  • Tanaka, E.A; Nozawa, S.R.; Macedo, A.A.; Baranauskas, J.A. A multi-label approach using binary relevance and decision trees applied to functional genomics. Journal of Biomedical Informatics, v. 54, p. 85-95, 2015.
    (DOI 10.1016/j.jbi.2014.12.011)

2013

  • Lira, F., Perez, P.S., Baranauskas, J.A., Nozawa, S.R., Prediction of Antimicrobial Activity of Synthetic Peptides by a Decision Tree Model, Appl Environ Microbiol., 2013.
    (DOI 10.1128/AEM.02804-12

2012

  • Baranauskas, J.A. The number of classes as a source for instability of decision tree algorithms in high dimensional datasets, Artificial Intelligence Review, 2012.
    (DOI 10.1007/s10462-012-9374-7)
  • Caffé, M.I.R., Perez, P.S., Baranauskas, J.A. Evaluation of Stacking on Biomedical Data, Journal of Health Informatics, ISSN 2175-4411, v.4, n.3, pp 67-72, 2012.
    (PDF)
  • Oshiro, T. M., Perez, P. S., Baranauskas, J. A. How Many Trees in a Random Forest? In Proceedings of the 8th International Conference on Machine Learning and Data Mining in Pattern Recognition, MLDM 2012, Berlin, Germany, July 13-20, Lecture Notes in Computer Science vol. 7376, ISBN 978-3-642-31536-7, pp. 154-168, 2012.
    (DOI 10.1007/978-3-642-31537-4_13)
  • Netto, O. P., Baranauskas, J. A. An Iterative Decision Tree Threshold Filter. In Proceedings of the XXXII Congress of the Brazilian Computer Society, XII Workshop on Medical Informatics, 10p., Curitiba, PR, Brazil, 2012, ISSN 2175-2761.
    (PDF)
  • Tanaka, E. A., Baranauskas, J. A. An Adaptation of Binary Relevance for Multi-Label Classification applied to Functional Genomics. In Proceedings of the XXXII Congress of the Brazilian Computer Society, XII Workshop on Medical Informatics, 10p., Curitiba, PR, Brazil, 2012, ISSN 2175-2761.
    (PDF)
  • Oshiro T. M., Baranauskas, J. A. Root Attribute Behavior within a Random Forest. In Proceedings of the 13th International Conference on Intelligent Data Engineering and Automated Learning, Natal, RN, Brazil, August 29-31, Lecture Notes in Computer Science vol. 7435, pp. 733-742, 2012.
    (DOI 10.1007/978-3-642-32639-4_87)
  • Pollettini, Juliana T., Panico, Sylvia R. G., Daneluzzi, Julio C., Tinós, R., Baranauskas, José A., Macedo, Alessandra A. Using Machine Learning Classifiers to Assist Healthcare-Related Decisions: Classification of Electronic Patient Records. Journal of Medical Systems, v. 36, pp. 3861-3874, 2012.
    (DOI 10.1007/s10916-012-9859-6)

2011

  • Perez, P. S., Baranauskas, J. A. Analysis of Decision Tree Pruning Using Windowing in Medical Datasets with
    Different Class Distributions. In Proceedings of the ECML PKDD Workshop on Knowledge Discovery in Health Care and Medicine (European Conference on Machine Learning and Principles and Practice of Knowledge Discovery in Databases), Athens, Greece, 2011, pp. 28-39.
    (PDF, PDF)
  • Perez, P. S., Bevilacqua, A. H., Ghelfi, A., Macedo, A. A., Nozawa, S. R., Baranauskas, J. A., A Software Tool for Information Management and Data Mining of Biological Data for Studying Adaptation of Living Organisms in Amazonia, In Proceedings of the International Conference on Computational Biosciences and Bio-Informatics (ICCBBI 2011), July 2011, Bhubaneswar, India.
    (PDF)
  • Caffe, M. I. R., Perez, P. S., Baranauskas, J. A. Avaliação do Algoritmo de Stacking em Dados Biomédicos. In XXXI Congresso da Sociedade Brasileira de Computação, XI Workshop de Informática Médica, 10p., Natal, RN, Brasil, 2011, ISSN 2175-2761.
    Artigo premiado como melhor artigo completo do evento.
    (PDF)
  • Netto, O. P., Macedo, A. A., Azevedo Marques, P. M., Baranauskas, J. A. Uma Metodologia para Estruturação de Laudos Médicos usando Ontologias. In XXXI Congresso da Sociedade Brasileira de Computação, XI Workshop de Informática Médica, 10p., Natal, RN, Brasil, 2011, ISSN 2175-2761.
    (PDF)

2010

  • Sales, L. D. F., Fugimoto, P. M., Passos, A. D. C., Pereira Júnior, G. A., Alves, D., Baranauskas, J. A. Análise da Metodologia TRISS em Pacientes Traumatizados do Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto. In XII Congresso Brasileiro de Informática em Saúde, 6p., Porto de Galinhas, PE, Brasil, 2010, ISSN 2178-2857.
    (PDF)
  • Tanaka, E. A., Junta, C. M., Vagnini, L., Baranauskas, J. A., Giuliatti, S. Um Sistema Computacional integrando Suporte à Decisão na Área de Reprodução Humana. In XII Congresso Brasileiro de Informática em Saúde, 6p., Porto de Galinhas, PE, Brasil, 2010, ISSN 2178-2857.
    (PDF)
  • Netto, O. P., Nozawa, S. R., Mitrowsky, R. A. R., Macedo, A. A., Baranauskas, J. A. Applying decision trees to gene expression data from DNA microarrays: A leukemia case study. In Proceedings of the XXX Congress of the Brazilian Computer Society, X Workshop on Medical Informatics, 10p., Belo Horizonte, MG, Brazil, 2010, ISSN 2175-2761.
    (PDF)
  • Oshiro, T. M., Carvalho, S. P. M., Peres, A. S., Tinós, R., Silva, R. H. A., Baranauskas, J. A. Avaliação da identificação do sexo de pessoas não identificadas por meio de radiografias faciais com o uso de métodos de aprendizado de máquina. In XXX Congresso da Sociedade Brasileira de Computação, X Workshop de Informática Médica, 10p., Belo Horizonte, MG, Brasil, 2010, ISSN 2175-2761.
    (PDF)

2009

  • Fugimoto, P. M., Sales, L. D. F., Pereira Júnior, G. A., Passos, A. D. C., Alves, D., Baranauskas, J. A. Análise Comparativa entre Árvores de Decisão e TRISS na Predição de Sobrevida de Pacientes Traumatizados. In IV Congresso da Academia Trinacional de Ciências, 2009, Foz do Iguaçu, PR, Brasil, 10p., 2009, ISSN 1982-2758.
    (PDF)
  • Pollettini, J. T., Nicolas, F. P., Panico, S. R. G., Daneluzzi, J. C., Tinós, R., Baranauskas, J. A., Macedo, A. A. A software architecture-based framework supporting suggestion of medical surveillance level from classification of electronic patient records In: The 12th IEEE International Conference on Computational Science and Engineering, 2009, Vancouver, Canadá. International Conference on Computational Science and Engineering, pp.166-173, 2009.
    (DOI 10.1109/CSE.2009.231)

2008

  • Garcia Cairasco, N., Rossetti, F., Arisi, G. M., Foresti, M. L., Bertti, P., Castro, O. W., Fernandes, A., Borragini, D. C., Rodrigues, M. C., Romcy Pereira, R. N., Baranauskas, J. A. Experimental and Human Epileptogenic Circuits as Sources of Complexity and Emergent Properties Suitable for Neural Network Modeling In: 62nd Annual Meeting of the American Epilepsy Society, 2008, Seattle, WA. American Epilepsy Society. Oxon, England: BLACKWELL PUBLISHING, 2008. v.49. pp.342-343
    (PDF)
  • Annibal, L. P., Rosa, N. A., Marques, P. M. A., Baranauskas, J. A., Felipe, J. C. Uma Ontologia para Estruturação da Informação contida em Laudos Radiológicos In: XI Congresso Brasileiro de Informática em Saúde, 2008, Campos do Jordão, SP. Anais do XI Congresso Brasileiro de Informática em Saúde. Apresentação Oral. 2008.
  • Annibal, L. P., Baranauskas, J. A., Felipe, J. C., Proposta de Estrutura de Informação para Laudos Radiológicos In: Simpósio Internacional de Iniciação Científica da Universidade de São Paulo - SIICUSP, 2008, São Paulo. Painel. 2008.

2007

  • Lemos, R. N., Baranauskas, J. A. Avaliação de Arredondamento de Valores de Atributos Contínuos em Diferentes Paradigmas de Aprendizado de Máquina, Relatório Técnico FFCLRP-USP, 112 p., 2007.
    (PDF)
  • Picchi Netto, O., Baranauskas, J. A., Zanette, D. L. Análise de Leucemias por meio de Perfis de Expressão Gênica utilizando Aprendizado de Máquina, Relatório Técnico FFCLRP-USP, 46 p., 2007.

2006

  • Lemos, R. N., Baranauskas, J. A. Avaliação de Arredondamento de Valores de Atributos Contínuos na Indução de Árvores de Decisão, Relatório Técnico FFCLRP-USP, 45 p., 2006.
    (PDF)
  • Lemos, R. N., Baranauskas, J. A. Uma Avaliação de Dados de Expressão Gênica em Leucemias Agudas Utilizando Árvores de Decisão In: X Congresso Brasileiro de Informática em Saúde, 2006, Florianópolis, SC. Anais do X Congresso Brasileiro de Informática em Saúde. Painel. 2006.
    (PDF)

2005

  • Leone, F.A.; Baranauskas, J.A.; Furriel, R.P.M. & Borin, I.A., SigrafW: An Easy-to-use Program for Fitting Enzyme Kinetics Data, Biochemistry and Molecular Biology Education, v. 33, n. 6, pp. 399-403, 2005.
    (DOI 10.1002/bmb.2005.49403306399)

2004

  • Lemos, R. N., Baranauskas, J. A. Avaliação de Arredondamento de Valores de Atributos Contínuos na Indução de Árvores de Decisão In: Simpósio Internacional de Iniciação Científica da Universidade de São Paulo - SIICUSP, 2004, São Paulo. Painel. 2004.
    (PDF)

2003

2001

  • Baranauskas, J. A., Extração Automática de Conhecimento Utilizando Múltiplos Indutores, PhD. Thesis, ICMC, 2001.
    (PDF, also available at Biblioteca Digital de Teses e Dissertações)
  • Prati, R. C., Baranauskas, J. A. & Monard, M. C., Uma Proposta de Unificação da Linguagem de Representação de Conceitos de Algoritmos de Aprendizado de Máquina Simbólicos, Technical Report 137, ICMC-USP, 2001.
    (PDF, also available at ICMC-USP)
  • Prati, R. C., Baranauskas, J. A. & Monard, M. C., Extração de Informações Padronizadas para a Avaliação de Regras Induzidas por Algoritmos de Aprendizado de Máquina Simbólico, Technical Report 145, ICMC-USP, 2001.
    (PDF, also available at ICMC-USP)
  • Prati, R. C., Baranauskas, J. A. & Monard, M. C., Padronização da sintaxe e informações sobre regras induzidas a partir de algoritmos de aprendizdo de máquina simbólico, Revista Eletrônica de Iniciação Científica (REIC), v.2., n 3, pp.1-20, 2002.
    (PDF)

2000

  • Baranauskas, J. A. & Monard, M. C., An Approach for Extracting Symbolic Ensembles from Databases, Proceedings 21st Iberian Latin American Congress on Computational Methods in Engineering (CILAMCE) [in CD-ROM], L. E. Vaz (ed.) LMC/EPUSP, Rio de Janeiro, 2000.
    (PDF)
  • Baranauskas, J. A. & Monard, M. C., An Environment for Rule Extraction and Evaluation from Databases, Proceedings of the IBERAMIA/SBIA, M. C. Monard and J. S. Sichman (eds.), pp. 187-196, 2000.
    (PDF)
  • Monard, M. C. & Baranauskas, J. A., Aplicações de Inteligência Artificial: Uma Visão Geral, I Congresso de Lógica Aplicada à Tecnologia (LAPTEC) ISBN 85-85795-29-8, pp. 339-348, Out. 2000.
    (PDF)
  • Lee, H.D., Monard, M.C.; Baranauskas, J.A. A Practical Approach for Knowledge-Driven Constructive Induction. Argentine Symposium on Artificial Intelligence (ASAI/JAIIO/SADIO), pp. 71-85, Sept. 2000.
    (PDF)
  • Baranauskas, J. A., Monard, M. C., Batista, G. E. A. P. A. A Computational Environment for Extracting Rules from Databases, Proceedings of the Second International Conference on Data Mining, N. Ebecken and C. A. Brebbia (eds.), Cambridge, UK, pp. 321-330, Jul. 2000.
    (PDF)
  • Silva-Júnior, W.A., Costa, M.C.R., Baranauskas, J.A., Dias-Neto, E., Souza, S.J., Simpson, A.J.G., Zago, M.A., Identification of Single Nucleotide Polymorphisms of Expressed Genes in Breast Carcinoma Cells by the Analysis of an Expressed Sequence Tags (E.S.T.) Data Bank, International Conference on Microbial and Model Genomes, Paris, France, pp. 74, Apr. 2000.
  • Baranauskas, J. A. & Monard, M. C., An Unified Overview of Six Machine Learning Inducers, Technical Report 103, ICMC-USP, Feb. 2000.
    (PDF, also available at ICMC-USP)
  • Baranauskas, J. A. & Monard, M. C., Reviewing some Machine Learning Concepts and Methods, Technical Report 102, ICMC-USP, Feb. 2000.
    (PDF, also available at ICMC-USP)

1999

  • Prati, R. C., Baranauskas, J. A. & Monard, M. C., BibView: Um Sistema para Auxiliar a Manutenção de Registros para o BibTeX, Technical Report 95, ICMC-USP, Oct. 1999.
    (PDF, also available at ICMC-USP)
  • Lee, H. D., Monard, M. C. & Baranauskas, J. A., Empirical Comparison of Wrapper and Filter Approaches for Feature Subset Selection, Technical Report 94, ICMC-USP, Oct. 1999.
    (PDF, also available at ICMC-USP)
  • Baranauskas, J. A.;  Monard, M. C. & Horst, P.S., Evaluation of CN2 Induced Rules Using Feature Selection, Argentine Symposium on Artificial Intelligence (ASAI/JAIIO/SADIO), Buenos Aires, pp. 141-154, Sept. 1999.
    (PS PDF)
  • Baranauskas, J. A.;  Monard, M. C. & Horst, P.S., Evaluation of Feature Selection by Wrapping around the CN2 Inducer, Encontro Nacional de Inteligência Artificial (ENIA/SBC), Rio de Janeiro, RJ, pp. 315-326, Jul. 1999.
    (PS PDF)
  • Baranauskas, J. A. & Monard, M. C., The MLC++ Wrapper for Feature Subset Selection Using Decision Tree, Production Rule, Instance Based and Statistical Inducers: Some Experimental Results, Technical Report 87, ICMC-USP, Jul. 1999.
    (PDF, also available at ICMC-USP)

1998

  • Baranauskas, J. A. & Monard, M. C., Metodologias para Seleção de Atributos, Workshop de Teses e Dissertações do Simpósio Brasileiro de Inteligência Artificial (SBIA), Porto Alegre, RS, Nov. 1998.
    (PS PDF)
  • Baranauskas, J. A. & Monard, M. C., Experimental Feature Selection using the Wrapper Approach, Proceedings of the International Conference on Data Mining (ICDM), Rio de Janeiro, RJ, pp. 161-170, Sept. 1998.
    (PS PDF)
  • Monard, M. C.; Caulkins, C. W.; Baranauskas, J. A.; Oliveira, R. B. T. & Rezende, S. O., Data Preparation, Reduction and Prediction in the Context of Data Mining: A Case Study with Insurance Policies, Technical Report 81, ICMC-USP, Nov. 1998.
    (PDF, also available at ICMC-USP)

1995

  • Leone, F.A; Baranauskas, J.A. & Ciancaglini, P., ENZYPLOT: A Microcomputer Assisted Program for Teaching Enzyme Kinetics, Biochemical Education, 23 (1), pp. 35-37, 1995.
    (DOI)

1992

  • Degrève, L. & Baranauskas, J.A., Aplicatividade da Simulação Reversa de Monte Carlo e Fluídos de Esferas Rígidas, XV Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada, Caxambú, MG, 148, 1992.
  • Leone, F.A; Degrève, L. & Baranauskas, J.A., SIGRAF: A Versatile Computer Program for the Fitting of Enzyme Kinetic Data, Biochemical Education, 20 (2), pp. 94-96, 1992.

1991

  • Borin, I.A.; Quintale, C.Jr.; Baranauskas, J.A. & Degrève, L., Interações Interiônicas Efetivas em Curta Distância, XIV Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada, Caxambú, MG, 139, 1991.
  • Degrève, L. & Baranauskas, J.A., Comportamento Hidrodinâmico da Formação de Pares Iônicos, XIV Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada, Caxambú, MG, 140, 1991.

 

Last update: 13/06/2017